Первый визит состоялся в ноябре 2000 года — Путин приехал на празднование 50-летия НГТУ, встретился с учёными Института ядерной физики и руководителями регионов СФО, пообщался с горожанами. В январе 2005 года он обсуждал создание технопарков с председателем СО РАН Николаем Добрецовым, а в декабре того же года открывал НОВАТ после реконструкции. В октябре 2007 года Путин участвовал в Форуме приграничных регионов России и Казахстана с Назарбаевым.
В марте 2013 года президент посетил авиазавод имени Чкалова и возложил цветы к памятнику Покрышкину. В 2014 году он дважды приезжал в Новосибирск: на совещание по развитию СФО и открытие Бугринского моста. В 2018 году также было два визита: в феврале — в Академгородок в День науки, в августе — на форум «Технопром» и в школу № 2 в Оби. Официального подтверждения визита на открытие «СКИФа» пока нет.
