По версии следствия, бывший генеральный директор клуба Андрей Перлов с мая 2020 по август 2022 года похитил 21 млн рублей, выделенных из бюджета минспорта Новосибирской области. Деньги, как считает обвинение, были похищены при заключении договоров аренды.
Также бывший директор с другими фигурантами дела (главным бухгалтером и начальником управления по футболу) подозреваются в хищении еще 3,2 млн рублей при заключении договора на обслуживание футбольного поля.