Как выяснилось позднее, самолет был сбит зенитной ракетой, запущенной ПВО Украины во время российско-украинских военных учений в Крыму. Лайнер в это время находился на высоте 11 000 метров примерно в 200 километрах юго-западнее Сочи. Попадание ракеты в пассажирский самолет было признано непреднамеренным. Несмотря на это президент Украины Леонид Кучма признал ответственность своей страны за случившееся. В отставку были отправлены высшие военные чины Украины.
Спустя два года Украина подписала межправительственное соглашение с Израилем и Россией – родственникам погибших были выплачены денежные компенсации. Жизнь каждого погибшего была оценена в 200 тысяч долларов США, российской стороне были выплачены 7,8 млн долларов России и чуть меньше – Израилю.
Несмотря на выплату компенсации и заявление президента Кучмы, как государство Украина ответственность за трагедию нести отказалась; уголовное дело по факту катастрофы было закрыто, поскольку расследование не обнаружило данных, указывавших на то, что Ту-154 сбит ракетой, запущенной во время учений украинских войск.