Для этого дополнительно были открыты затворы трех пролетов водосливной плотины на один метр. Увеличение сбросов сделано для поддержания водохранилища на отметке нормального подпорного уровня и обеспечения резервной емкости водохранилища для приема дождевого паводка.
Новосибирское водохранилище продолжает оставаться единственной преградой от резких подъемов воды, вызванных дождевыми паводками. Избыток воды аккумулируется в водохранилище ГЭС, при этом противопаводковые возможности водохранилища напрямую зависят от размера его резервной (свободной) емкости. В настоящее время Новосибирское водохранилище заполнено до отметки 113,34 м, что близко к отметке его нормального подпорного уровня — 113,5 м. В связи с этим необходимо увеличение резервной емкости водохранилища, что при условии полной загрузки турбин может быть произведено только при помощи холостых сбросов.
Режим работы регулируется не столько самой ГЭС, сколько специально уполномоченной государственной организацией — Федеральным агентством водных ресурсов. Все изменения водного режима работы Новосибирской ГЭС производятся по команде уполномоченного органа ФАВР по Новосибирской области — Верхне-Обского бассейнового водного управления. При корректировке режимов работы ГЭС учитываются интересы всех заинтересованных водопользователей: речного флота, объектов тепловой электроэнергетики, Горводоканала, рыбоводства, МЧС, администрации г. Новосибирска, правительства области.
В настоящий момент приток к створу станции составляет 3 692 куб. м/с, расходы в нижний бьеф (через гидроагрегаты и водосброс) — 3 565 куб. м/с, уровень верхнего бьефа — 113,34 (НПУ — 113,5), уровень нижнего бьефа — 95,86 м.
Недавно стало известно, что дождевой паводок сформировался в горах Алтая уже во второй половине августа. По информации Федерального государственного бюджетного учреждения «Западно-Сибирское управление по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды» приток в Новосибирское водохранилище в третьей декаде августа составит 3 570 +/- 220 куб. м/с, пик притока в водохранилище пришелся на 27 августа и составил ориентировочно 4 000 куб. м/с.
Сейчас гидротехнические сооружения Новосибирской ГЭС полностью готовы к пропуску дождевого паводка: имеются техника, оборудование, автотранспорт для оперативной ликвидации возможных повреждений, а также специальные акустические устройства, находящиеся в шестикилометровом радиусе действия звукового покрытия ниже по течению реки Обь (локальная система оповещения).
